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神药的末路,以及推特学术的胜利

拍老师 拍帮主的后花园 2023-10-24

各位新年好!
话说,前段时间M记神药在国内上市,为了表示庆祝,当时咱随便写了一点小八卦来着。

——点击下图跳转原文:
上面那篇小八卦,主要说的是M药诱致突变的风险。
这种风险吧,各位作为个人健康的第一责任人来说,完全不用太在意,
但对于好不容易撂下挑子的公卫机构来说,却可能是巨大的潜在威胁。


不过上次写得比较匆忙,没怎么掉书袋,

更重要的是,居然忘了例行豁胖这你们敢信?


至于为啥要豁胖?

因为那篇小八卦吧,

其实是在恶意抢跑……

里边儿很多信息当时都属于全网独家来着


之,十几天之后的现在,那篇小八卦的相关预印本,终于上线了~

于是咱第一时间搬运过来,

算是把上次某些语焉不详的地方补完吧,

另外还顺带讲个关于推特学术的励志段子,

希望各位喜欢。




——开门见山,请品鉴:

传送门:

https://doi.org/10.1101/2023.01.26.23284998


标题翻译成人话:

《从新冠病毒测序记录数据库中发现与M记神药有关联的突变特征》


简单来说:

  • M记神药是一种世界范围内广泛使用的针对新冠病毒的抗病毒药物,它的作用机制是诱导病毒基因组发生突变。

  • 一般认为,绝大多数随机突变都不会给病毒带来增益,反而会损害其适应性,或者说其中不少甚至会导致病毒失活。

  • 作为验证,M记神药之前在动物模型当中已经实锤可以有效降低病毒载量。

  • 可是呢,在实际用药过程中,并不能排除某些患者嗑药之后,仍然不能完全清除感染,甚至有可能把经历过M药加速突变之后的病毒继续传播给其他人。

  • 而这篇预印本的目的,就是在全球测序记录数据库(主要是GISAID)里面系统性地找出来那些带有M药诱致突变特征的序列。


下面快进到结果环节:

  • 作者们果然找到了一系列具有高辨识度特征的疑似测序记录;

  • 这些序列从2022年M药上市之后才开始冒头,并且在地理分布和年龄层上也和M药的使用范围相吻合;

  • 作者们进一步根据当初M药临床试验资料,计算出M药的特征突变谱,然后比对了上述疑似序列。

  • 最后作者们认为,公共数据库里的这些疑似序列,跟M药的特征突变谱完全吻合,并且这些疑似序列当中的一小撮,已经有续发传播的证据。


至于M药的特征突变谱到底长啥样?
上一集里面已经简单解说过,这里就不重复了,感兴趣的朋友不妨自行回顾。

这里搬运一下预印本第一作者Theo Sanderson老师的原话(很凑巧,Theo桑也是咱公众号老熟人之一了)

Theo桑表示:
  • "M药作为针对新冠病毒的小分子抗病毒药物,在全球早已售出上千万盒,虽然近期有不少研究在质疑这货的药效,但咱们这篇预印本不一样……咱们打算证明的是——自从M药面世以来,市面上出现了不少阴间变异株——这些变异株可能跟M药有关联。”


↑ 右上角红框框出来的小红点,就是带有M药其中一个特征突变谱(G>A突变比例异常)的疑似序列。

  • "并且这些疑似序列的地理分布,跟M药的使用范围高度吻合。”
↑ 越往右上角,越是重灾区,尤其是土澳、美帝、英国和日本四家……

  • "由于M药是现在几种小分子抗病毒药物里面用药禁忌相对较少的一种,所以通常在老年人当中使用更普遍——而疑似序列对应的感染者年龄,刚好也显著高于平均值。”
↑ 左边是M药相关疑似序列对应的感染者年龄,右边是大盘平均数。

  • “以土澳为例,M药已经是养老院的常备药,一旦70岁以上老人确诊,无论症状如何,一律推荐磕M药。而我们在土澳发现了一组带有M药相关突变谱的高度同源序列,从年龄上判断,有可能正是养老院爆发场景……”

  • “至于这个所谓的特征突变谱到底有多么特异?请看剑桥大学Chris Ruiz老师的表演……”
↑ 一图秒懂了可以说是~

最后,Theo桑总结道:
"总之,GISAID里面充斥着带有M药相关特征突变谱的阴间序列,这一点咱们基本已经算是盖棺定论啦(conclusively demonstrated)!"



下面进入喜闻乐见的推特学术励志段子环节。

话说,这篇预印本作者名单里的老熟人们,其实远不止Theo桑一位~

——请品鉴:

↑ 除了Theo桑之外,还有Ryan桑、Peacock老师,以及Chris Ruis老师等,都曾被咱公众号搬运过……


其中,今天这个推特学术励志段子的主角,就是上边儿名单里划了重点的,身为"independent researcher"(独立研究人员)的Ryan Hisner。


今天这篇预印本之所以能成型,

军功章至少有一半属于Ryan桑~

因为早在去年9月份,他就敏锐地带头揪出了当时还十分罕见的带有M药关联疑似测序记录。

之后Ryan桑更是锲而不舍,单枪匹马从GISAID上找出好几百条疑似序列,还额外花时间归类汇总~

可以说,这篇预印本的原始数据,几乎都是Ryan桑一人包办的。


——来自Peacock老师的鸣谢:

“Massive credit to @LongDesertTrain who first spotted these odd sequences and has tirelessly chronicled them.”可还行?

(@longdeserttrain是Ryan桑的推特中二网名)


然而各位可能想不到的是,

这位Ryan桑吧,他其实完全不是混学术圈儿的(至少以前不是)。


——请品鉴:

↑ Bsc学位,教育专业,在某个红州菜场中学当老师……


大流行以来,Ryan桑迷上了小蓝鸟,这两年开始大肆搞起了新冠相关的推特学术……

按照国内的标准来划分,Ryan桑这属于妥妥的民科了可以说


然而小蓝鸟是非多,尤其是变异株追踪的相关内容吧,难免会伴生一些焦虑,

于是怒怼Ryan桑的minimizer可以说此起彼伏,

其中更是有人爱拿他场中学老师的身份来事儿~

——比如说,请品鉴:


可是吧,Ryan桑的牛鼻之处就在于,

身为中学老师,身为只有Bsc学位的民科,

Ryan桑他愣是争取到了一大波顶流大佬为他站台……


——比如说,大伙儿熟悉的Bloom老师:


——再比如说,大伙儿同样熟悉的Ravi Gupta老师:

就问各位服不服!


当然了,最牛鼻的是……

由于这哥们儿搞推特学术太猛,

从去年开始,不止一位PI主动联系了Ryan桑……

于是就在前几天,

Ryan桑他滋滋地跟着Ben Murrell老师去也

(就是咱《天阶序论》系列经常搬运的那位Murrell老师)


靠着推特灌水,民科华丽丽转正,

就问各位励志不励志?





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